Les techniques avancées dans le séquençage de l'ADN et de l'ARN ont ouvert la possibilité d'étudier les celLules individuelles dans les tissus d'une manière pLus complète que ce qui était auparavant possible.Le grand défi avec ces techniques de séquençage est qu'ils conduisent à de grandes quantités de données.
"Lorsque vous souhaitez distinguer les celLules cancéreuses des celLules normales, par exemple, vous devez examiner des milliers de celLules pour obtenir une compréhension appropriée, ce qui se traduit par d'énormes quantités de données numériques", explique Shamit Soneji, chercheur en biologie informatique à l'Université Lund.
Pour rendre ces données compréhensibles, chaque celLule est positionnée mathématiquement dans un espace tridimensionnel pour former une "feuille de route" des celLules, et comment elles se rapportent les unes aux autres.Cependant, ces cartes peuvent être difficiles à naviguer à l'aide d'un ordinateur de bureau régulier.
"Pour pouvoir vous promener dans vos propres données et les manipuler intuitivement et efficacement une toute nouvelle compréhension.J'irais en fait jusqu'à dire que l'on pense différemment en VR, grâce à la capacité de la technique à impliquer votre corps dans le processus d'analyse ", explique Mattias Wallergård.chercheur en conception d'interaction et réalité virtuelle à l'Université Lund.
L'équipe de l'Université de Lund a développé le logiciel Cellexalvr;un environnement de réalité virtuelle qui permet aux chercheurs d'utiliser des outils intuitifs pour explorer toutes leurs données en un seul endroit.Les cartes 3D des celLules qui ont été calculées à partir de l'activité des gènes et d'autres informations capturées à partir de celLules individuelles peuvent être affichées, et le chercheur peut clairement voir quels gènes sont actifs lorsque certains types de celLules sont formés.
À l'aide d'un casque VR, l'utilisateur a un univers complet de populations de celLules devant eux et peut déterminer pLus précisément comment les celLules se rapportent les uns aux autres.En utilisant deux contrôleurs de main, ils peuvent sélectionner des celLules d'intérêt pour une analyse pLus approfondie avec des gestes de la main simples comme s'il s'agissait d'objets physiques.
Étant donné que l'espace n'est pas un problème, il est possible d'avoir pLusieurs cartes celLulaires dans la même "pièce" et de les comparer côte à côte, ce qui est difficile sur un écran d'ordinateur traditionnel.Les chercheurs peuvent également se réunir dans ce monde VR pour analyser les données ensemble, bien qu'ils soient dans différents endroits géographiquement.
"Même si vous n'êtes pas familier avec la programmation informatique, ce type d'analyse est ouvert à tout le monde.Un monde virtuel est un domaine de recherche en développement rapide qui a un énorme potentiel pour les scientifiques qui doivent accéder et traiter les grosses données d'une manière pLus interactive et collaborative ", concLut Shamit Soneji.
The software can be downloaded for free at https://www.Cellexalvr.méditer.Lu.se /
